Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GSK3BP49841 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GSK3BP49841 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GSK3BP49841 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GSK3BP49841 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSK3BP49841 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSK3BP49841 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSK3BP49841 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GSK3BP49841 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSK3BP49841 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GSK3BP49841 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GSK3BP49841 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GSK3BP49841 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GSK3BP49841 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GSK3BP49841 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GSK3BP49841 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSK3BP49841 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSK3BP49841 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GSK3BP49841 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSK3BP49841 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GSK3BP49841 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GSK3BP49841 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GSK3BP49841 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSK3BP49841 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GSK3BP49841 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSK3BP49841 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSK3BP49841 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GSK3BP49841 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GSK3BP49841 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GSK3BP49841 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSK3BP49841 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GSK3BP49841 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSK3BP49841 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSK3BP49841 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSK3BP49841 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSK3BP49841 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSK3BP49841 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSK3BP49841 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GSK3BP49841 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSK3BP49841 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSK3BP49841 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GSK3BP49841 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSK3BP49841 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GSK3BP49841 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSK3BP49841 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GSK3BP49841 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GSK3BP49841 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GSK3BP49841 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSK3BP49841 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GSK3BP49841 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GSK3BP49841 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GSK3BP49841 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSK3BP49841 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GSK3BP49841 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GSK3BP49841 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSK3BP49841 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSK3BP49841 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSK3BP49841 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GSK3BP49841 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSK3BP49841 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSK3BP49841 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GSK3BP49841 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSK3BP49841 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms