Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSEN2P49810 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSEN2P49810 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms