Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HARS2P49590 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HARS2P49590 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HARS2P49590 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HARS2P49590 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HARS2P49590 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HARS2P49590 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HARS2P49590 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HARS2P49590 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HARS2P49590 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HARS2P49590 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HARS2P49590 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HARS2P49590 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HARS2P49590 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HARS2P49590 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HARS2P49590 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HARS2P49590 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HARS2P49590 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HARS2P49590 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HARS2P49590 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HARS2P49590 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HARS2P49590 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HARS2P49590 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HARS2P49590 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HARS2P49590 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HARS2P49590 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HARS2P49590 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HARS2P49590 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HARS2P49590 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HARS2P49590 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HARS2P49590 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HARS2P49590 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HARS2P49590 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HARS2P49590 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HARS2P49590 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HARS2P49590 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HARS2P49590 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HARS2P49590 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HARS2P49590 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HARS2P49590 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HARS2P49590 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HARS2P49590 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HARS2P49590 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HARS2P49590 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HARS2P49590 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HARS2P49590 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HARS2P49590 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HARS2P49590 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HARS2P49590 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HARS2P49590 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HARS2P49590 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HARS2P49590 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HARS2P49590 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HARS2P49590 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HARS2P49590 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HARS2P49590 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HARS2P49590 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HARS2P49590 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HARS2P49590 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HARS2P49590 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HARS2P49590 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HARS2P49590 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HARS2P49590 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HARS2P49590 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HARS2P49590 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HARS2P49590 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HARS2P49590 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HARS2P49590 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HARS2P49590 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HARS2P49590 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HARS2P49590 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HARS2P49590 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HARS2P49590 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HARS2P49590 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HARS2P49590 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HARS2P49590 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HARS2P49590 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HARS2P49590 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HARS2P49590 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HARS2P49590 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HARS2P49590 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HARS2P49590 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HARS2P49590 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HARS2P49590 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HARS2P49590 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HARS2P49590 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HARS2P49590 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HARS2P49590 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HARS2P49590 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HARS2P49590 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HARS2P49590 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HARS2P49590 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HARS2P49590 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HARS2P49590 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HARS2P49590 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HARS2P49590 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HARS2P49590 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HARS2P49590 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HARS2P49590 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HARS2P49590 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms