Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNI2P48788 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNI2P48788 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms