Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC1A6P48664 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC1A6P48664 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A6P48664 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms