Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC1P48547 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNC1P48547 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms