Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GNPDA1P46926 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNPDA1P46926 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms