Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPL28P46779 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPL28P46779 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPL28P46779 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPL28P46779 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPL28P46779 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPL28P46779 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPL28P46779 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPL28P46779 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPL28P46779 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPL28P46779 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPL28P46779 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPL28P46779 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPL28P46779 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPL28P46779 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPL28P46779 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPL28P46779 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPL28P46779 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPL28P46779 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPL28P46779 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPL28P46779 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPL28P46779 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPL28P46779 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPL28P46779 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPL28P46779 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPL28P46779 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPL28P46779 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPL28P46779 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPL28P46779 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RPL28P46779 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPL28P46779 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPL28P46779 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPL28P46779 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPL28P46779 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPL28P46779 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPL28P46779 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPL28P46779 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPL28P46779 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPL28P46779 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPL28P46779 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RPL28P46779 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPL28P46779 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPL28P46779 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPL28P46779 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPL28P46779 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPL28P46779 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPL28P46779 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPL28P46779 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPL28P46779 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPL28P46779 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPL28P46779 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RPL28P46779 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPL28P46779 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPL28P46779 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPL28P46779 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPL28P46779 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPL28P46779 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPL28P46779 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPL28P46779 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPL28P46779 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPL28P46779 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPL28P46779 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPL28P46779 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RPL28P46779 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPL28P46779 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RPL28P46779 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPL28P46779 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RPL28P46779 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPL28P46779 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPL28P46779 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPL28P46779 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPL28P46779 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPL28P46779 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPL28P46779 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPL28P46779 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPL28P46779 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPL28P46779 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPL28P46779 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPL28P46779 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPL28P46779 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPL28P46779 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPL28P46779 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPL28P46779 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPL28P46779 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPL28P46779 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPL28P46779 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPL28P46779 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPL28P46779 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPL28P46779 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPL28P46779 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPL28P46779 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPL28P46779 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPL28P46779 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RPL28P46779 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPL28P46779 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPL28P46779 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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