Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CBP42338 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms