Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC19A1P41440 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC19A1P41440 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms