Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THPOP40225 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THPOP40225 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THPOP40225 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THPOP40225 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THPOP40225 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THPOP40225 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THPOP40225 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THPOP40225 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THPOP40225 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
THPOP40225 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THPOP40225 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THPOP40225 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THPOP40225 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THPOP40225 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THPOP40225 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THPOP40225 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THPOP40225 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THPOP40225 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THPOP40225 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THPOP40225 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THPOP40225 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THPOP40225 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THPOP40225 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THPOP40225 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THPOP40225 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THPOP40225 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THPOP40225 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THPOP40225 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THPOP40225 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THPOP40225 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THPOP40225 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THPOP40225 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
THPOP40225 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THPOP40225 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THPOP40225 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
THPOP40225 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THPOP40225 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THPOP40225 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
THPOP40225 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THPOP40225 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THPOP40225 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THPOP40225 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THPOP40225 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THPOP40225 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THPOP40225 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THPOP40225 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THPOP40225 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THPOP40225 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THPOP40225 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THPOP40225 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THPOP40225 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THPOP40225 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THPOP40225 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THPOP40225 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THPOP40225 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
THPOP40225 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THPOP40225 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THPOP40225 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THPOP40225 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THPOP40225 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THPOP40225 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THPOP40225 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THPOP40225 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THPOP40225 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THPOP40225 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THPOP40225 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THPOP40225 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THPOP40225 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THPOP40225 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THPOP40225 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THPOP40225 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THPOP40225 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THPOP40225 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THPOP40225 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THPOP40225 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THPOP40225 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THPOP40225 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THPOP40225 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THPOP40225 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THPOP40225 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THPOP40225 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
THPOP40225 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THPOP40225 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THPOP40225 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THPOP40225 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THPOP40225 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
THPOP40225 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THPOP40225 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THPOP40225 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THPOP40225 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THPOP40225 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THPOP40225 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THPOP40225 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THPOP40225 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THPOP40225 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THPOP40225 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THPOP40225 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THPOP40225 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THPOP40225 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms