Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPGP40121 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPGP40121 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPGP40121 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPGP40121 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPGP40121 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPGP40121 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPGP40121 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPGP40121 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPGP40121 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPGP40121 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPGP40121 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPGP40121 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPGP40121 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPGP40121 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPGP40121 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPGP40121 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPGP40121 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPGP40121 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPGP40121 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPGP40121 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPGP40121 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPGP40121 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPGP40121 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPGP40121 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPGP40121 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPGP40121 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPGP40121 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPGP40121 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPGP40121 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPGP40121 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPGP40121 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPGP40121 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPGP40121 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPGP40121 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPGP40121 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPGP40121 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPGP40121 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPGP40121 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPGP40121 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPGP40121 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPGP40121 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPGP40121 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPGP40121 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPGP40121 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPGP40121 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPGP40121 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPGP40121 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPGP40121 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPGP40121 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPGP40121 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPGP40121 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPGP40121 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPGP40121 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPGP40121 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPGP40121 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPGP40121 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPGP40121 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPGP40121 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPGP40121 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPGP40121 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPGP40121 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPGP40121 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPGP40121 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPGP40121 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPGP40121 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPGP40121 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPGP40121 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPGP40121 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPGP40121 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPGP40121 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPGP40121 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPGP40121 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPGP40121 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPGP40121 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPGP40121 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPGP40121 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPGP40121 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPGP40121 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPGP40121 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPGP40121 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPGP40121 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPGP40121 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPGP40121 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPGP40121 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPGP40121 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPGP40121 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPGP40121 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPGP40121 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPGP40121 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPGP40121 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPGP40121 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPGP40121 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPGP40121 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPGP40121 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAPGP40121 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPGP40121 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPGP40121 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPGP40121 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAPGP40121 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms