Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGCXP38435 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGCXP38435 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGCXP38435 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGCXP38435 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGCXP38435 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGCXP38435 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGCXP38435 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGCXP38435 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGCXP38435 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGCXP38435 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGCXP38435 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GGCXP38435 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGCXP38435 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGCXP38435 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GGCXP38435 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGCXP38435 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GGCXP38435 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
GGCXP38435 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGCXP38435 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGCXP38435 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGCXP38435 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGCXP38435 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGCXP38435 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGCXP38435 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGCXP38435 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGCXP38435 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GGCXP38435 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GGCXP38435 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GGCXP38435 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GGCXP38435 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GGCXP38435 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GGCXP38435 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GGCXP38435 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GGCXP38435 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GGCXP38435 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GGCXP38435 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GGCXP38435 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GGCXP38435 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGCXP38435 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGCXP38435 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGCXP38435 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGCXP38435 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGCXP38435 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGCXP38435 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGCXP38435 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGCXP38435 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGCXP38435 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGCXP38435 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGCXP38435 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGCXP38435 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGCXP38435 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GGCXP38435 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGCXP38435 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGCXP38435 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGCXP38435 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGCXP38435 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGCXP38435 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGCXP38435 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGCXP38435 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGCXP38435 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GGCXP38435 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGCXP38435 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGCXP38435 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGCXP38435 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGCXP38435 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGCXP38435 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGCXP38435 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGCXP38435 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGCXP38435 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGCXP38435 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGCXP38435 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GGCXP38435 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGCXP38435 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGCXP38435 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GGCXP38435 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGCXP38435 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GGCXP38435 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGCXP38435 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGCXP38435 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGCXP38435 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GGCXP38435 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GGCXP38435 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GGCXP38435 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GGCXP38435 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GGCXP38435 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGCXP38435 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGCXP38435 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGCXP38435 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGCXP38435 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGCXP38435 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GGCXP38435 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGCXP38435 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GGCXP38435 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGCXP38435 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGCXP38435 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGCXP38435 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GGCXP38435 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGCXP38435 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGCXP38435 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms