Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HNF1BP35680 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HNF1BP35680 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HNF1BP35680 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms