Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP214P35658 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP214P35658 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP214P35658 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP214P35658 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP214P35658 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP214P35658 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP214P35658 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP214P35658 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP214P35658 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP214P35658 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP214P35658 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP214P35658 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP214P35658 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP214P35658 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP214P35658 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP214P35658 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP214P35658 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP214P35658 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP214P35658 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP214P35658 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP214P35658 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP214P35658 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP214P35658 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP214P35658 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP214P35658 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NUP214P35658 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP214P35658 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
NUP214P35658 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP214P35658 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP214P35658 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP214P35658 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP214P35658 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP214P35658 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP214P35658 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP214P35658 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP214P35658 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP214P35658 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP214P35658 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP214P35658 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUP214P35658 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP214P35658 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP214P35658 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP214P35658 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP214P35658 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP214P35658 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP214P35658 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP214P35658 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP214P35658 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP214P35658 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP214P35658 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP214P35658 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP214P35658 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP214P35658 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP214P35658 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP214P35658 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP214P35658 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP214P35658 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP214P35658 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP214P35658 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP214P35658 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP214P35658 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP214P35658 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP214P35658 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP214P35658 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP214P35658 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP214P35658 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP214P35658 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP214P35658 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP214P35658 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NUP214P35658 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP214P35658 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP214P35658 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP214P35658 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP214P35658 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP214P35658 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP214P35658 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP214P35658 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP214P35658 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP214P35658 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP214P35658 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP214P35658 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP214P35658 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP214P35658 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP214P35658 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP214P35658 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP214P35658 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP214P35658 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP214P35658 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP214P35658 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP214P35658 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP214P35658 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP214P35658 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP214P35658 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP214P35658 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP214P35658 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP214P35658 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP214P35658 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUP214P35658 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUP214P35658 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.2 ms