Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCK1P35558 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCK1P35558 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCK1P35558 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCK1P35558 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCK1P35558 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCK1P35558 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PCK1P35558 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCK1P35558 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCK1P35558 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PCK1P35558 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCK1P35558 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCK1P35558 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCK1P35558 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCK1P35558 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCK1P35558 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCK1P35558 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCK1P35558 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCK1P35558 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCK1P35558 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCK1P35558 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCK1P35558 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCK1P35558 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCK1P35558 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCK1P35558 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCK1P35558 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCK1P35558 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCK1P35558 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCK1P35558 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCK1P35558 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCK1P35558 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCK1P35558 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCK1P35558 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCK1P35558 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCK1P35558 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCK1P35558 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCK1P35558 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCK1P35558 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCK1P35558 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCK1P35558 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCK1P35558 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCK1P35558 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCK1P35558 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCK1P35558 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCK1P35558 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCK1P35558 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCK1P35558 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCK1P35558 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCK1P35558 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCK1P35558 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCK1P35558 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCK1P35558 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCK1P35558 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCK1P35558 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCK1P35558 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCK1P35558 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PCK1P35558 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCK1P35558 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCK1P35558 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCK1P35558 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCK1P35558 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCK1P35558 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCK1P35558 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCK1P35558 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCK1P35558 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCK1P35558 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCK1P35558 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCK1P35558 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCK1P35558 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCK1P35558 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCK1P35558 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCK1P35558 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCK1P35558 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCK1P35558 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCK1P35558 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCK1P35558 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCK1P35558 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCK1P35558 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCK1P35558 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCK1P35558 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCK1P35558 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCK1P35558 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCK1P35558 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCK1P35558 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCK1P35558 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCK1P35558 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCK1P35558 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCK1P35558 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCK1P35558 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCK1P35558 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCK1P35558 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCK1P35558 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCK1P35558 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCK1P35558 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCK1P35558 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCK1P35558 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCK1P35558 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCK1P35558 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCK1P35558 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCK1P35558 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms