Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORAP35398 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RORAP35398 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RORAP35398 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RORAP35398 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RORAP35398 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RORAP35398 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RORAP35398 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RORAP35398 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RORAP35398 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RORAP35398 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RORAP35398 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RORAP35398 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RORAP35398 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORAP35398 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORAP35398 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORAP35398 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORAP35398 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORAP35398 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORAP35398 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RORAP35398 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RORAP35398 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORAP35398 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RORAP35398 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RORAP35398 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORAP35398 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORAP35398 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORAP35398 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RORAP35398 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORAP35398 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORAP35398 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RORAP35398 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RORAP35398 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RORAP35398 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RORAP35398 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RORAP35398 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RORAP35398 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RORAP35398 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RORAP35398 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RORAP35398 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RORAP35398 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RORAP35398 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RORAP35398 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RORAP35398 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RORAP35398 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RORAP35398 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RORAP35398 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RORAP35398 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RORAP35398 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RORAP35398 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RORAP35398 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RORAP35398 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RORAP35398 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RORAP35398 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RORAP35398 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RORAP35398 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RORAP35398 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RORAP35398 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RORAP35398 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RORAP35398 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RORAP35398 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RORAP35398 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RORAP35398 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORAP35398 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORAP35398 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORAP35398 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORAP35398 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORAP35398 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORAP35398 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RORAP35398 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORAP35398 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORAP35398 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORAP35398 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORAP35398 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORAP35398 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORAP35398 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RORAP35398 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RORAP35398 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RORAP35398 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RORAP35398 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RORAP35398 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RORAP35398 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RORAP35398 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORAP35398 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORAP35398 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORAP35398 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORAP35398 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORAP35398 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORAP35398 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORAP35398 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORAP35398 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORAP35398 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORAP35398 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORAP35398 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORAP35398 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RORAP35398 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RORAP35398 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RORAP35398 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RORAP35398 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RORAP35398 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms