Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCKBRP32239 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCKBRP32239 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms