Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HOXA10P31260 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HOXA10P31260 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms