Protein–RNA interactions for Protein: P30876

POLR2B, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2BP30876 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2BP30876 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2BP30876 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms