Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLIP1P30622 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLIP1P30622 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms