Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP1P29466 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP1P29466 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP1P29466 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP1P29466 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP1P29466 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP1P29466 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP1P29466 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP1P29466 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP1P29466 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP1P29466 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP1P29466 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP1P29466 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP1P29466 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP1P29466 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP1P29466 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP1P29466 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP1P29466 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP1P29466 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP1P29466 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP1P29466 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP1P29466 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP1P29466 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP1P29466 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP1P29466 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP1P29466 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP1P29466 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP1P29466 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP1P29466 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP1P29466 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP1P29466 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP1P29466 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP1P29466 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP1P29466 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP1P29466 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP1P29466 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP1P29466 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP1P29466 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP1P29466 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP1P29466 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP1P29466 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP1P29466 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP1P29466 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP1P29466 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP1P29466 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP1P29466 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP1P29466 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP1P29466 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP1P29466 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP1P29466 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP1P29466 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP1P29466 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP1P29466 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP1P29466 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP1P29466 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP1P29466 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP1P29466 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP1P29466 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP1P29466 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP1P29466 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP1P29466 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP1P29466 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP1P29466 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP1P29466 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP1P29466 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP1P29466 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP1P29466 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP1P29466 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP1P29466 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP1P29466 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP1P29466 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP1P29466 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP1P29466 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP1P29466 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP1P29466 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP1P29466 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP1P29466 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP1P29466 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP1P29466 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP1P29466 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP1P29466 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP1P29466 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP1P29466 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP1P29466 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP1P29466 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP1P29466 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP1P29466 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP1P29466 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP1P29466 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP1P29466 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP1P29466 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP1P29466 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP1P29466 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP1P29466 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP1P29466 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP1P29466 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP1P29466 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP1P29466 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP1P29466 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP1P29466 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms