Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARID4AP29374 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID4AP29374 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID4AP29374 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms