Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

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Length 983 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
EPHA3P29320 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHA3P29320 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHA3P29320 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHA3P29320 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHA3P29320 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHA3P29320 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHA3P29320 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHA3P29320 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHA3P29320 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHA3P29320 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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