Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB2P29033 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB2P29033 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB2P29033 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB2P29033 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB2P29033 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB2P29033 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB2P29033 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB2P29033 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB2P29033 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB2P29033 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB2P29033 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB2P29033 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB2P29033 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB2P29033 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB2P29033 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB2P29033 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB2P29033 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB2P29033 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB2P29033 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB2P29033 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB2P29033 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJB2P29033 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB2P29033 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB2P29033 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB2P29033 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB2P29033 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB2P29033 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB2P29033 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB2P29033 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB2P29033 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB2P29033 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB2P29033 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB2P29033 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB2P29033 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB2P29033 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB2P29033 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB2P29033 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB2P29033 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB2P29033 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB2P29033 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB2P29033 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB2P29033 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB2P29033 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB2P29033 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJB2P29033 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJB2P29033 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJB2P29033 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJB2P29033 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJB2P29033 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GJB2P29033 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJB2P29033 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJB2P29033 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJB2P29033 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB2P29033 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB2P29033 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB2P29033 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB2P29033 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB2P29033 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB2P29033 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB2P29033 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB2P29033 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB2P29033 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB2P29033 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB2P29033 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB2P29033 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB2P29033 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB2P29033 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB2P29033 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB2P29033 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB2P29033 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB2P29033 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB2P29033 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB2P29033 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB2P29033 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB2P29033 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB2P29033 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB2P29033 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB2P29033 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB2P29033 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB2P29033 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GJB2P29033 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB2P29033 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB2P29033 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB2P29033 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB2P29033 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB2P29033 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB2P29033 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB2P29033 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB2P29033 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB2P29033 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB2P29033 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB2P29033 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB2P29033 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB2P29033 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB2P29033 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB2P29033 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB2P29033 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB2P29033 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJB2P29033 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms