Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD38P28907 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD38P28907 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD38P28907 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD38P28907 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD38P28907 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD38P28907 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD38P28907 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD38P28907 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CD38P28907 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD38P28907 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD38P28907 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD38P28907 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD38P28907 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CD38P28907 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CD38P28907 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD38P28907 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD38P28907 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CD38P28907 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD38P28907 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD38P28907 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD38P28907 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD38P28907 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD38P28907 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD38P28907 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD38P28907 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD38P28907 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD38P28907 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD38P28907 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD38P28907 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD38P28907 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD38P28907 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD38P28907 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD38P28907 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD38P28907 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD38P28907 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD38P28907 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD38P28907 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD38P28907 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD38P28907 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD38P28907 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD38P28907 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD38P28907 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD38P28907 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD38P28907 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD38P28907 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD38P28907 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD38P28907 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD38P28907 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD38P28907 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD38P28907 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD38P28907 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD38P28907 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD38P28907 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD38P28907 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD38P28907 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD38P28907 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD38P28907 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD38P28907 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD38P28907 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD38P28907 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD38P28907 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD38P28907 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD38P28907 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD38P28907 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD38P28907 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD38P28907 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD38P28907 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD38P28907 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD38P28907 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CD38P28907 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD38P28907 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD38P28907 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD38P28907 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD38P28907 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD38P28907 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD38P28907 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD38P28907 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CD38P28907 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD38P28907 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD38P28907 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD38P28907 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD38P28907 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD38P28907 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD38P28907 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD38P28907 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD38P28907 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD38P28907 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD38P28907 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD38P28907 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD38P28907 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD38P28907 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD38P28907 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD38P28907 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD38P28907 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD38P28907 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD38P28907 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD38P28907 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD38P28907 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD38P28907 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms