Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
POU1F1P28069 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms