Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARSP26640 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARSP26640 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VARSP26640 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VARSP26640 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VARSP26640 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VARSP26640 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VARSP26640 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARSP26640 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARSP26640 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARSP26640 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARSP26640 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARSP26640 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARSP26640 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARSP26640 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARSP26640 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARSP26640 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARSP26640 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARSP26640 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARSP26640 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARSP26640 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARSP26640 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARSP26640 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARSP26640 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARSP26640 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARSP26640 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARSP26640 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARSP26640 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARSP26640 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARSP26640 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARSP26640 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARSP26640 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARSP26640 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARSP26640 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARSP26640 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VARSP26640 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VARSP26640 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VARSP26640 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VARSP26640 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VARSP26640 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VARSP26640 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VARSP26640 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARSP26640 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARSP26640 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARSP26640 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VARSP26640 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARSP26640 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARSP26640 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARSP26640 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VARSP26640 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARSP26640 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARSP26640 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARSP26640 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARSP26640 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARSP26640 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARSP26640 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARSP26640 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VARSP26640 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARSP26640 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARSP26640 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARSP26640 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARSP26640 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARSP26640 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARSP26640 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARSP26640 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARSP26640 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARSP26640 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARSP26640 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARSP26640 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARSP26640 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARSP26640 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARSP26640 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARSP26640 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARSP26640 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARSP26640 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARSP26640 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARSP26640 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARSP26640 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VARSP26640 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VARSP26640 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARSP26640 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VARSP26640 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARSP26640 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARSP26640 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARSP26640 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARSP26640 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARSP26640 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARSP26640 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARSP26640 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARSP26640 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARSP26640 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VARSP26640 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARSP26640 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VARSP26640 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VARSP26640 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VARSP26640 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VARSP26640 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VARSP26640 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
VARSP26640 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VARSP26640 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms