Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA2P24043 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMA2P24043 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMA2P24043 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMA2P24043 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMA2P24043 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms