Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF4BP23588 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
EIF4BP23588 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms