Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ITGA6P23229 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITGA6P23229 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGA6P23229 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms