Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPAP23025 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPAP23025 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPAP23025 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPAP23025 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPAP23025 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XPAP23025 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPAP23025 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPAP23025 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPAP23025 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPAP23025 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPAP23025 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPAP23025 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPAP23025 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPAP23025 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPAP23025 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XPAP23025 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPAP23025 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPAP23025 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XPAP23025 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XPAP23025 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPAP23025 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPAP23025 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XPAP23025 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPAP23025 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPAP23025 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPAP23025 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPAP23025 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPAP23025 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPAP23025 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPAP23025 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPAP23025 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPAP23025 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPAP23025 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPAP23025 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPAP23025 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPAP23025 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPAP23025 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPAP23025 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPAP23025 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPAP23025 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPAP23025 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPAP23025 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPAP23025 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPAP23025 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPAP23025 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPAP23025 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPAP23025 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPAP23025 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
XPAP23025 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPAP23025 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPAP23025 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPAP23025 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPAP23025 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPAP23025 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPAP23025 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPAP23025 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPAP23025 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPAP23025 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPAP23025 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPAP23025 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPAP23025 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPAP23025 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPAP23025 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XPAP23025 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPAP23025 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPAP23025 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPAP23025 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPAP23025 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPAP23025 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XPAP23025 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPAP23025 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPAP23025 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPAP23025 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPAP23025 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XPAP23025 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPAP23025 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPAP23025 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XPAP23025 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPAP23025 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPAP23025 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPAP23025 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPAP23025 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPAP23025 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPAP23025 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPAP23025 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPAP23025 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPAP23025 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPAP23025 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPAP23025 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XPAP23025 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPAP23025 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XPAP23025 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XPAP23025 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XPAP23025 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPAP23025 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPAP23025 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPAP23025 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPAP23025 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPAP23025 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms