Protein–RNA interactions for Protein: P20839

IMPDH1, Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase 1, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPDH1P20839 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMPDH1P20839 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMPDH1P20839 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMPDH1P20839 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMPDH1P20839 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMPDH1P20839 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMPDH1P20839 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMPDH1P20839 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IMPDH1P20839 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms