Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VCAM1P19320 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms