Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR1P18146 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR1P18146 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR1P18146 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR1P18146 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR1P18146 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR1P18146 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR1P18146 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR1P18146 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR1P18146 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR1P18146 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR1P18146 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR1P18146 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR1P18146 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR1P18146 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR1P18146 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR1P18146 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR1P18146 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR1P18146 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR1P18146 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR1P18146 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR1P18146 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR1P18146 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR1P18146 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR1P18146 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR1P18146 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR1P18146 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGR1P18146 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGR1P18146 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGR1P18146 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGR1P18146 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGR1P18146 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGR1P18146 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGR1P18146 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGR1P18146 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGR1P18146 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGR1P18146 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR1P18146 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR1P18146 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR1P18146 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR1P18146 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR1P18146 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR1P18146 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR1P18146 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR1P18146 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR1P18146 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR1P18146 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR1P18146 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR1P18146 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR1P18146 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EGR1P18146 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EGR1P18146 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EGR1P18146 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR1P18146 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR1P18146 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR1P18146 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR1P18146 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR1P18146 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR1P18146 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR1P18146 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR1P18146 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR1P18146 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR1P18146 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR1P18146 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR1P18146 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR1P18146 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EGR1P18146 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EGR1P18146 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EGR1P18146 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EGR1P18146 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EGR1P18146 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EGR1P18146 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EGR1P18146 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EGR1P18146 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EGR1P18146 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR1P18146 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR1P18146 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR1P18146 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR1P18146 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR1P18146 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR1P18146 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR1P18146 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR1P18146 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR1P18146 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR1P18146 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EGR1P18146 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR1P18146 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR1P18146 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR1P18146 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR1P18146 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR1P18146 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR1P18146 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR1P18146 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR1P18146 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR1P18146 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR1P18146 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EGR1P18146 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR1P18146 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR1P18146 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EGR1P18146 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms