Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
XBP1P17861 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XBP1P17861 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XBP1P17861 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XBP1P17861 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XBP1P17861 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
XBP1P17861 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XBP1P17861 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XBP1P17861 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XBP1P17861 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
XBP1P17861 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XBP1P17861 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XBP1P17861 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XBP1P17861 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
XBP1P17861 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
XBP1P17861 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XBP1P17861 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XBP1P17861 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XBP1P17861 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XBP1P17861 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XBP1P17861 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XBP1P17861 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XBP1P17861 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XBP1P17861 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XBP1P17861 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XBP1P17861 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XBP1P17861 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XBP1P17861 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XBP1P17861 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XBP1P17861 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XBP1P17861 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XBP1P17861 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
XBP1P17861 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XBP1P17861 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XBP1P17861 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
XBP1P17861 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XBP1P17861 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XBP1P17861 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XBP1P17861 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
XBP1P17861 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XBP1P17861 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XBP1P17861 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XBP1P17861 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XBP1P17861 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XBP1P17861 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XBP1P17861 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XBP1P17861 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XBP1P17861 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XBP1P17861 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XBP1P17861 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
XBP1P17861 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
XBP1P17861 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
XBP1P17861 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
XBP1P17861 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XBP1P17861 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XBP1P17861 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XBP1P17861 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XBP1P17861 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XBP1P17861 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XBP1P17861 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XBP1P17861 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XBP1P17861 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XBP1P17861 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XBP1P17861 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XBP1P17861 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XBP1P17861 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XBP1P17861 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XBP1P17861 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
XBP1P17861 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XBP1P17861 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XBP1P17861 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
XBP1P17861 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
XBP1P17861 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
XBP1P17861 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XBP1P17861 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XBP1P17861 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XBP1P17861 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XBP1P17861 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XBP1P17861 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XBP1P17861 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
XBP1P17861 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XBP1P17861 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XBP1P17861 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XBP1P17861 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XBP1P17861 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XBP1P17861 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XBP1P17861 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XBP1P17861 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XBP1P17861 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XBP1P17861 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XBP1P17861 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XBP1P17861 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XBP1P17861 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XBP1P17861 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XBP1P17861 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XBP1P17861 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XBP1P17861 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XBP1P17861 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XBP1P17861 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XBP1P17861 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms