Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DESP17661 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DESP17661 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DESP17661 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DESP17661 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DESP17661 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DESP17661 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DESP17661 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DESP17661 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DESP17661 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DESP17661 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DESP17661 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DESP17661 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DESP17661 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DESP17661 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DESP17661 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DESP17661 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DESP17661 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DESP17661 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DESP17661 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DESP17661 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DESP17661 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DESP17661 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DESP17661 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DESP17661 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DESP17661 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DESP17661 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DESP17661 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DESP17661 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DESP17661 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DESP17661 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DESP17661 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DESP17661 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DESP17661 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DESP17661 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DESP17661 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DESP17661 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DESP17661 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DESP17661 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DESP17661 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DESP17661 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DESP17661 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DESP17661 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DESP17661 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DESP17661 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DESP17661 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DESP17661 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DESP17661 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DESP17661 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DESP17661 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DESP17661 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DESP17661 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DESP17661 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DESP17661 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DESP17661 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DESP17661 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DESP17661 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DESP17661 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DESP17661 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DESP17661 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DESP17661 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DESP17661 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DESP17661 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DESP17661 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DESP17661 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DESP17661 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DESP17661 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DESP17661 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DESP17661 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DESP17661 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DESP17661 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DESP17661 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DESP17661 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DESP17661 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DESP17661 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DESP17661 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DESP17661 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DESP17661 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DESP17661 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DESP17661 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DESP17661 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DESP17661 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DESP17661 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DESP17661 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DESP17661 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DESP17661 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DESP17661 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DESP17661 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DESP17661 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DESP17661 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DESP17661 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DESP17661 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DESP17661 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DESP17661 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DESP17661 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DESP17661 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DESP17661 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DESP17661 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DESP17661 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DESP17661 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms