Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMPD1P17405 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMPD1P17405 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms