Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFXP16104 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFXP16104 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFXP16104 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms