Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT13P13646 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT13P13646 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT13P13646 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT13P13646 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT13P13646 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT13P13646 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT13P13646 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT13P13646 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT13P13646 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT13P13646 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT13P13646 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT13P13646 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT13P13646 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT13P13646 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT13P13646 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT13P13646 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT13P13646 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT13P13646 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT13P13646 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT13P13646 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT13P13646 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT13P13646 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT13P13646 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT13P13646 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT13P13646 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT13P13646 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT13P13646 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT13P13646 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT13P13646 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT13P13646 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT13P13646 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT13P13646 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT13P13646 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT13P13646 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT13P13646 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT13P13646 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT13P13646 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT13P13646 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT13P13646 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT13P13646 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT13P13646 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT13P13646 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT13P13646 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT13P13646 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT13P13646 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT13P13646 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT13P13646 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT13P13646 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT13P13646 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT13P13646 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT13P13646 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT13P13646 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT13P13646 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT13P13646 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT13P13646 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT13P13646 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT13P13646 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT13P13646 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT13P13646 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT13P13646 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT13P13646 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT13P13646 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT13P13646 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT13P13646 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT13P13646 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT13P13646 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT13P13646 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT13P13646 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT13P13646 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT13P13646 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT13P13646 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT13P13646 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT13P13646 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT13P13646 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT13P13646 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT13P13646 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT13P13646 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT13P13646 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT13P13646 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT13P13646 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT13P13646 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT13P13646 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT13P13646 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT13P13646 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT13P13646 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT13P13646 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT13P13646 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT13P13646 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT13P13646 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT13P13646 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT13P13646 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT13P13646 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT13P13646 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT13P13646 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT13P13646 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT13P13646 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT13P13646 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT13P13646 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT13P13646 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms