Protein–RNA interactions for Protein: P13591

NCAM1, Neural cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM1P13591 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAM1P13591 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms