Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ODC1P11926 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ODC1P11926 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ODC1P11926 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ODC1P11926 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ODC1P11926 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ODC1P11926 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ODC1P11926 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ODC1P11926 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ODC1P11926 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ODC1P11926 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ODC1P11926 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ODC1P11926 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ODC1P11926 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ODC1P11926 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ODC1P11926 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ODC1P11926 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ODC1P11926 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ODC1P11926 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ODC1P11926 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ODC1P11926 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ODC1P11926 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ODC1P11926 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ODC1P11926 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ODC1P11926 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ODC1P11926 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ODC1P11926 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ODC1P11926 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ODC1P11926 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ODC1P11926 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ODC1P11926 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ODC1P11926 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ODC1P11926 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODC1P11926 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODC1P11926 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODC1P11926 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODC1P11926 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODC1P11926 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODC1P11926 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ODC1P11926 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODC1P11926 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODC1P11926 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODC1P11926 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODC1P11926 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODC1P11926 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ODC1P11926 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ODC1P11926 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ODC1P11926 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ODC1P11926 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ODC1P11926 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ODC1P11926 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ODC1P11926 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODC1P11926 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODC1P11926 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODC1P11926 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODC1P11926 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODC1P11926 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODC1P11926 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODC1P11926 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ODC1P11926 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ODC1P11926 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODC1P11926 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODC1P11926 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODC1P11926 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODC1P11926 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ODC1P11926 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ODC1P11926 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ODC1P11926 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ODC1P11926 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ODC1P11926 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ODC1P11926 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ODC1P11926 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ODC1P11926 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ODC1P11926 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ODC1P11926 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ODC1P11926 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ODC1P11926 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ODC1P11926 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ODC1P11926 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ODC1P11926 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ODC1P11926 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ODC1P11926 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ODC1P11926 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ODC1P11926 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ODC1P11926 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ODC1P11926 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ODC1P11926 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ODC1P11926 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ODC1P11926 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ODC1P11926 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ODC1P11926 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ODC1P11926 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ODC1P11926 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ODC1P11926 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ODC1P11926 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ODC1P11926 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ODC1P11926 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ODC1P11926 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ODC1P11926 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ODC1P11926 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms