Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP2C9P11712 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP2C9P11712 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms