Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRM1P11229 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms