Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP3P10745 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP3P10745 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP3P10745 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP3P10745 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP3P10745 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP3P10745 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP3P10745 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP3P10745 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP3P10745 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP3P10745 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP3P10745 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP3P10745 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP3P10745 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP3P10745 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP3P10745 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP3P10745 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP3P10745 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP3P10745 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP3P10745 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP3P10745 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP3P10745 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP3P10745 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP3P10745 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP3P10745 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP3P10745 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP3P10745 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP3P10745 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP3P10745 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP3P10745 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP3P10745 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP3P10745 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP3P10745 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP3P10745 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP3P10745 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP3P10745 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP3P10745 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP3P10745 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP3P10745 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBP3P10745 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP3P10745 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP3P10745 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP3P10745 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP3P10745 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP3P10745 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP3P10745 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP3P10745 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP3P10745 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP3P10745 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP3P10745 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP3P10745 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP3P10745 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP3P10745 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP3P10745 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP3P10745 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP3P10745 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP3P10745 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP3P10745 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP3P10745 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP3P10745 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP3P10745 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP3P10745 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP3P10745 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP3P10745 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP3P10745 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP3P10745 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP3P10745 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP3P10745 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP3P10745 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP3P10745 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP3P10745 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP3P10745 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP3P10745 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP3P10745 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP3P10745 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP3P10745 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP3P10745 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP3P10745 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP3P10745 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP3P10745 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP3P10745 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP3P10745 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP3P10745 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP3P10745 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP3P10745 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP3P10745 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP3P10745 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP3P10745 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP3P10745 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP3P10745 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP3P10745 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP3P10745 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP3P10745 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP3P10745 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP3P10745 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP3P10745 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP3P10745 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP3P10745 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP3P10745 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP3P10745 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms