Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARAP10276 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARAP10276 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARAP10276 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARAP10276 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARAP10276 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARAP10276 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARAP10276 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARAP10276 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RARAP10276 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARAP10276 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARAP10276 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARAP10276 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARAP10276 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARAP10276 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARAP10276 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARAP10276 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARAP10276 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARAP10276 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARAP10276 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARAP10276 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARAP10276 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARAP10276 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARAP10276 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARAP10276 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARAP10276 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARAP10276 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARAP10276 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARAP10276 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARAP10276 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARAP10276 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARAP10276 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARAP10276 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARAP10276 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARAP10276 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARAP10276 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARAP10276 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARAP10276 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARAP10276 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARAP10276 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARAP10276 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARAP10276 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARAP10276 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARAP10276 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARAP10276 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARAP10276 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARAP10276 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARAP10276 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RARAP10276 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARAP10276 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARAP10276 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARAP10276 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARAP10276 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARAP10276 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARAP10276 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARAP10276 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARAP10276 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARAP10276 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARAP10276 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARAP10276 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARAP10276 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARAP10276 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARAP10276 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARAP10276 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARAP10276 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARAP10276 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARAP10276 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARAP10276 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARAP10276 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RARAP10276 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RARAP10276 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RARAP10276 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARAP10276 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARAP10276 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARAP10276 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARAP10276 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARAP10276 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARAP10276 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARAP10276 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARAP10276 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARAP10276 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARAP10276 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARAP10276 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARAP10276 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARAP10276 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARAP10276 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARAP10276 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARAP10276 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARAP10276 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARAP10276 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARAP10276 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARAP10276 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARAP10276 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARAP10276 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARAP10276 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARAP10276 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RARAP10276 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARAP10276 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARAP10276 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARAP10276 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms