Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALM3P0DP25 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CALM3P0DP25 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms