Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC192P0DO97 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC192P0DO97 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms