Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C8orf89P0DMQ9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.9 ms