Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSH2P0DML3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSH2P0DML3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms